在云南地区，一般的代理记账公司注册费用在3000元10000元不等。具体的费用还会根据公司注册资本、行业特点、税务登记情况等因素进行调整。此外，一些代理记账公司还会根据客户需求提供其他服务，如商标注册、财务咨询等，这些服务费用也需要另行计算。

需要注意的是，云南代理记账公司注册费用虽然不高，但是在选择代理记账公司时，要根据公司的信誉度、服务质量、专业水平等多个因素进行综合考虑。只有选择了一家合适的代理记账公司，才能够确保公司的财务管理得到更好的保障。

在选择代理记账公司时，建议多家比较，了解各家公司的服务内容、费用标准等，然后再进行选择。同时，还需要留意一些不良代理记账公司的陷阱，如虚假宣传、隐瞒费用等，以免被坑骗。

总之，云南代理记账公司注册费用虽然不高，但是在选择时还需要慎重考虑，选择一家合适的代理记账公司，才能够更好地保障公司的财务管理。